Središče prizadevanj novoustanovljenega znanstvenega inštituta je pospeševanje prekomejnega znanstvenega sodelovanja univerz in znanstvenih inštitucij v Sloveniji in Avstriji. Tesno naj bi postalo sodelovanje tudi z avstrijskimi knjižnicami, arhivi, muzeji ipd., ker čaka po mnenju slovenskih zgodovinskih raziskovalcev še veliko slovenske zgodovinske dediščine na svoje odkritje in raziskovanje.

V Knaflovi hiši - Zgodovinsko pomemben je tudi kraj v katerem je nameščen nov inštitut. Hiša "Seilerstätte 2" je last Luka Knafljeve ustanove, ki je od leta 1676 naprej omogočila kar nekaj generacijam slovenskih študentov za časa habsburške monarhije študij na dunajski univerzi. Znani dobitniki Knafljeve štipendije so bili m.dr. slovenski pesniki France Prešeren, Oton Župančič, Ivan Tavčar, zgodovinar Franc Kos in geograf Anton Melik.

Direktor inštituta je dr. Vincenc Rajšp.